Transportasi jaringan kereta api mempunyai banyak keunggulan dibanding transportasi jalan antara lain; kapasitas angkut besar (massal), cepat, aman, hemat energi dan ramah lingkungan serta membutuhkan lahan yang relatif sedikit. Dengan semakin kuatnya isu lingkungan, maka keunggulan kereta api dapat dijadikan sebagai salah satu alasan yang kuat untuk membangun transportasi jaringan kereta api sehingga terwujud transportasi yang efektif, efisien dan ramah lingkungan.

Pembangunan Jaringan Kereta Api Balikpapan - Samarinda - Bontang - Sangata di Provinsi Kalimantan Timur diharapkan mampu menjadi tulang punggung angkutan barang dan angkutan penumpang perkotaan sehingga dapat menjadi salah satu penggerak utama perekonomian di Provinsi Kalimantan Timur. Penyelenggaraan  jaringan kereta api Balikpapan - Samarinda - Bontang - Sangata yang terintegrasi dengan moda transportasi lainnya dapat meningkatkan efisiensi penyelenggaraan infrastruktur di Provinsi Kalimantan Timur.